Efecto de la Dieta en el Microbioma Intestinal de Organismos Acuáticos
Keywords:
microbioma, NGS, organismos acuáticosAbstract
El tracto digestivo de los organismos esta colonizado por microorganismos que cumplen con variadas e
importantes funciones. Mucho se ha estudiado la microbiota del tracto digestivo en organismos terrestres, pero
poco en organismos acuáticos. Gracias a los recientes métodos de secuenciación masiva del ADN, se ha abierto
una ventana para explorar la composición taxonómica (microbiota) de los microorganismos no cultivables que
existen en todos los ecosistemas, y el intestinal no es la excepción. Además, también ha sido posible conocer
los genes que están presentes (microbioma) en esos sitios al secuenciar todo el ADN presente, lo que se conoce
como metagenómica.
Es ya conocido que la dieta es quizá el principal factor que puede alterar la composición tanto de la microbiota
como del microbioma en animales terrestres, pero es poco lo que se conoce en animales acuáticos. Los
principales factores que determinan el microbioma en peces son el nivel trófico (dieta), el hábitat y quizá su
posición filogenética (Sullam et al., 2012).
En el presente trabajo, se contemplarán solo los avances que se han realizado en el efecto de la dieta en la
microbiota y el microbioma obtenidos por métodos de secuenciación masiva, ya que éstos están menos sujetos
a desviaciones causadas por el método usado, como pueden ser especialmente los causados por métodos de
cultivo dependientes o incluso aquellos cultivos independientes pero de poca resolución como la electroforesis
en gel con gradientes desnaturalizantes (DGGE por sus siglas en inglés) o el análisis de conformación de una
sola hebra (SSCA).
Es ya plenamente conocido que el tracto intestinal de prácticamente todos los animales estudiados contiene una
alta cantidad de microorganismos comensales y una elevada diversidad taxonómica de éstos. El caso de los
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Gómez-Gil, B. et al. 2017. Efecto de la Dieta en el Microbioma Intestinal de Organismos Acuáticos. En: Cruz-Suárez, L.E., Ricque-Marie, D., Tapia-Salazar, M., Nieto-López, M.G.,
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Nuevo León, San Nicolás de los Garza, Nuevo León, México, pp. 570-581. ISBN 978-607-27-0822-8.
organismos acuáticos no es diferente y diversos estudios se han enfocado a caracterizar la microbiota o el
microbioma del tracto intestinal de peces y, en menor medida, de crustáceos.
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