Enfoques Transcriptómicos en el Jurel Seriola rivoliana
Keywords:
Seriola rivoliana, genómica funcional, nutriciónAbstract
Las investigaciones con las especies del género Seriola van en aumento por la importancia económica que
representan para varias regiones del planeta. Mediante las herramientas genómicas, el grupo de Fisiología y
Genómica Funcional del CIBNOR en colaboración con otras instituciones, están desarrollando diferentes
investigaciones que permitirán conocer la biología de la especie y así optimizar la producción de juveniles. Los
enfoques planteados en este trabajo comprenden el estudio de la ontogenia de diversos genes que permiten
conocer la evolución de algunos componentes del sistema inmune, así como de factores de crecimiento,
proliferación y diferenciación celular, en esquemas básicos de alimentación y en presencia de levaduras como
probióticos. Tras estos experimentos, el transcriptoma obtenido representa el primer registro bioinformático en
extenso para esta especie y permitirá realizar estudios de biología comparativa, expresión de genes
seleccionados bajo contextos experimentales diversos (nutrición, metabolismo, inmunología), y se constituye
como una base para la exploración de marcadores genético-poblacionales (SNPs, microsatélites). Por otro lado,
se presentan datos preliminares del uso de fitobióticos solos o combinados con probióticos, la presencia de
toxinas marinas y su efecto en la expresión de genes relacionados con el sistema inmune y al desarrollo de
larvas de jurel Seriola rivoliana.
Downloads
References
Angulo C, Maldonado M, Delgado K, Reyes-Becerril M (2017) Debaryomyces hansenii up regulates
superoxide dismutase gene expression and enhances the immune response and survival in Pacific red
snapper (Lutjanus peru) leukocytes after Vibrio parahaemolyticus infection. Developmental &
Comparative Immunology 71: 18-27
Augimeri RV, Strap JL (2015) The phytohormone ethylene enhances cellulose production, regulates
CRP/FNR(Kx) transcription and causes differential gene expression within the bacterial cellulose
synthesis operon of Komagataeibacter (Gluconacetobacter) xylinus ATCC 53582. Frontiers in
Microbiology 6: 1459.
Bolger AM, Lohse M, Usadel B (2014). Trimmomatic: A flexible trimmer for Illumina Sequence Data.
Bioinformatics, btu170.
Burgoin-Cota M (2015) Estudio de la incorporación de la levadura viva Debaryomyces hansenii a través del
rotífero Brachionus rotundiformis durante los primeros días de desarrollo del jurel Seriola rivoliana.
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste. Tesis maestría. 87 p.
Cho S, Choi Y, Park S, Park T (2012) Carvacrol prevents diet-induced obesity by modulating gene expressions
involved in adipogenesis and inflammation in mice fed with high-fat diet, J. Nutr. Biochem. 23: 192-
, doi:10.1016/j.jnutbio.2010.11.016.
Grabherr MG, Haas BJ, Yassour M, Levin JZ, Thompson DA, Amit I, et al. (2011) Full-length transcriptome
assembly from RNA-seq data without a reference genome. Nat Biotechnol. 29(7), 644-6452. doi:
1038/nbt.1883. PubMed PMID: 21572440.
Guzmán-Villanueva LT, Ascencio-Valle F, Macías-Rodríguez ME, Tovar-Ramírez D (2013) Effects of dietary
β-glucan 1,3/1,6 on the antioxidant and digestive enzyme activities of Pacific red snapper (Lutjanus
peru) after exposure to lipopolysaccharides. Fish. Physiol. Biochem. 40: 827-837.
Hassaan MS, Soltan MA (2016) Evaluation of Essential Oil of Fennel and Garlic Separately or Combined with
Bacillus licheniformis on the Growth, Feeding Behaviour, Hemato-biochemical Indices of
Oreochromis niloticus (L.) Fry, J. Aquac. Res. Dev. 7: 4-11.
Hotta M, Nakata R, Katsukawa M, Hori K, Takahashi S, Inoue H (2010) Carvacrol, a component of thyme oil,
activates PPARalpha and gamma and suppresses COX-2 expression, J. Lipid Res. 51: 132-139.
doi:10.1194/jlr.M900255-JLR200.
Karkabounas S, Kostoula OK, Daskalou T, Veltsistas P, Karamouzis M, Zelovitis I, et al. (2006)
Anticarcinogenic and antiplatelet effects of carvacrol, Exp. Oncol. 28: 121-125.
Kissinger KR, García-Ortega A, Trushenski JT (2016) Partial fish meal replacement by soy protein concentrate,
squid and algal meals in low fish-oil diets containing Schizochytrium limacinum for longfin yellowtail
Seriola rivoliana. Aquaculture 452: 37-44. doi:10.1016/j.aquaculture.2015.10.022.
Tovar-Ramírez, D. et al., 2017.Enfoques transcriptómicos en el jurel Seriola rivoliana. En: Cruz-Suárez, L.E., Ricque-Marie, D., Tapia-Salazar, M., Nieto-López, M.G., Villarreal-
Cavazos, D. A., Gamboa-Delgado, J., López Acuña, L.M. y Galaviz-Espinoza, M. . (Eds), Investigación y Desarrollo en Nutrición Acuícola Universidad Autónoma de Nuevo León,
San Nicolás de los Garza, Nuevo León, México, pp. 390-407. ISBN 978-607-27-0822-8.
Navarrete P, Tovar-Ramírez D (2014) Use of yeasts as probiotics in fish aquaculture, sustainable aquaculture
techniques. In Hernandez-Vergara M (Ed.), ISBN: 978-953-51-1224-2, InTech, DOI: 10.5772/57196.
Available from: http://www.intechopen.com/books/sustainable-aquaculture-techniques/use-of-yeastsas-
probiotics-in-fish-aquaculture
Le Du J, Tovar-Ramírez D, Núnez-Vázquez EJ (2017) Embryotoxic effects of dissolved okadaic acid on the
development of Longfin yellowtail Seriola rivoliana. Aquatic Toxicology 190: 210-216.
Lima MDS, Quintans-Júnior LJ, De-0Santana WA, Martins-Kaneto C, Pereira-Soares MB, Villarreal CF
(2013) Anti-inflammatory effects of carvacrol: Evidence for a key role of interleukin-10, Eur. J.
Pharmacol. 699: 112-117. doi:10.1016/j.ejphar.2012.11.040.
Pavey SA, Bernatchez L, Aubin-Horth N, Landry CR (2012). What is needed for next-generation ecological
and evolutionary genomics?. Trends in Ecology & Evolution 27: 673-678.
Reyes-Becerril M, Tovar-Ramírez D, Ascencio-Valle F, Civera-Cerecedo R, Gracia-López V, Barbosa-
Solomieu V (2008) Effects of dietary live yeast Debaryomyces hansenii on the immune and
antioxidant system in juvenile leopard grouper Mycteroperca rosacea exposed to stress. Aquaculture
: 39-44.
Reyes-Becerril M, Salinas I, Cuesta A, Meseguer J, Tovar-Ramírez D, Ascencio-Valle F, et al. (2008) Oral
delivery of live yeast Debaryomyces hansenii modulates the main innate immune parameters and the
expression of immune-relevant genes in the gilthead seabream (Sparus aurata L.). Fish and Shellfish
Immunology 25: 731-739.
Reyes-Becerril M, Tovar-Ramírez D, Ascencio-Valle F, Civera-Cerecedo R, Gracia-Lopez V, Barbosa-
Solomieu V, et al. (2011) Effects of dietary supplementation with probiotic live yeast on the immune
and antioxidant systems of leopard grouper Mycteroperca rosacea infected with Aeromonas
hydrophila, Aquaculture Research, 42: 1676-1686.
Reyes-Becerril MC, Ascencio-Valle F, Meseguer J, Tapia-Paniagua ST, Moriñigo MA, Esteban MA (2012)
Debaryomyces hasenii L2-enriched diets enhance the immunity status, gene expresssion and intestine
functionality in gilheadt seabream (Sparus aurata L.). Aquaculture research 43(8): 1107-1118
Tapia-Paniagua S T, Reyes-Becerril M, Ascencio-Valle F, Esteban MA, Clavijo E, Balebona MC, et a. (2011)
Modulation of the intestinal microbiota and immune system of farmed Sparus aurata by the
administration of the yeast Debaryomyces hansenii L2 in conjunction with inulin. J Aquac Res
Develop S, 1.
Teles A, Salas-Leiva J, Alvarez-González CA, Gisbert E, Ibarra-Castro L, Pérez-Urbiola JC, et al. (2017)
Histological and histochemical study of gastrointestinal tract of longfin yellowtail (Seriola rivoliana)
larvae, Fish. Physiol. Biochem, DOI: 10.1007/s10695-017-0397-5.
Tovar-Ramirez D, Mazurais D, Gatesoupe JF, Quazuguel P, Cahu CL, Zambonino-Infante JL (2010) Dietary
probiotic live yeast modulates antioxidant enzyme activities and gene expression of sea bass
(Dicentrarchus labrax) larvae. Aquaculture 300: 142-147.
Tovar-Ramírez, D. et al., 2017.Enfoques transcriptómicos en el jurel Seriola rivoliana. En: Cruz-Suárez, L.E., Ricque-Marie, D., Tapia-Salazar, M., Nieto-López, M.G., Villarreal-
Cavazos, D. A., Gamboa-Delgado, J., López Acuña, L.M. y Galaviz-Espinoza, M. . (Eds), Investigación y Desarrollo en Nutrición Acuícola Universidad Autónoma de Nuevo León,
San Nicolás de los Garza, Nuevo León, México, pp. 390-407. ISBN 978-607-27-0822-8.
Tovar D, Zambonino J, Cahu C, Gatesoupe FJ, Vázquez-Juárez R, Lésel R (2002) Effect of live yeast
incorporation in compound diet on digestive enzyme activity in sea bass larvae. Aquaculture 204: 113-
Tovar-Ramírez D, Zambonino J, Cahu C, Gatesoupe FJ. Vázquez-Juárez R (2004) Influence of dietary live
yeast on European sea bass (Dicentrarchus labrax) larval development. Aquaculture 234: 415-427.
Van Hai N (2015) The use of medicinal plants as immunostimulants in aquaculture: A review, Aquaculture.
: 88-96.
Windisch W, Schedle K, Plitzner C, Kroismayr A (2008) Use of phytogenic products as feed additives for swine
and poultry. J. Anim. Sci. 86: E140-148
